实验室 | 基础医学院系统生物医学研究所钟超课题组

     北京大学基础医学院主要从事生物医学领域的基础及应用基础研究，拥有雄厚的科学研究综合实力以及一批具备国际先进水平的科研基地和实验技术平台。接下来基础研会将为大家依次介绍基础医学院各大实验室，让大家对学院的科研状况能有更为深入的了解。本期将进行基础医学院系统生物医学研究所实验室推送，一起走进钟超课题组！

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实验室简介 

      钟超实验室成立于2017年，主要研究肠道、呼吸道、生殖道、皮肤等组织器官的区域免疫过程及其中的转录、代谢调节机制，探讨免疫系统异常与重大疾病发生、发展之间的联系。相关工作发表于Immunity（IF=31.745）、Nature Immunology（IF=20.479）等免疫学核心期刊。实验室常规技术手段包括实验动物模型构建、流式细胞分析、组织免疫荧光、高通量测序、生物信息分析等。目前实验室成员包括PI 1名、co-PI 1名、Technician 1名、Postdocs 2名、Students 10名。

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导师简介

     钟超，研究员，博士生导师，第13批国家海外高层次引进人才。主要研究区域免疫的转录、代谢调节机制及其与疾病发生、发展之间的联系，近年工作发表于Immunity（2014、2020）、Nature Immunology（2016）等期刊，获得国家自然科学基金、科技部重点研发计划等多个项目资助。兼任中国免疫学会临床免疫分会委员、中国病理生理学会系统生物医学专业委员会委员、中国生物物理学会肠道菌群分会副秘书长等职务。

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研究领域 

T细胞和天然淋巴细胞（ILC）是调节组织、器官的区域免疫稳态的重要免疫细胞。二者发育、功能及调节机制具有很强相似性。它们与感染、炎症、癌症、自身免疫病等的发生、发展也存在密切联系。相关研究对阐明区域免疫调节机制、揭示重大疾病发生发展过程具有重要意义。本实验室具备丰富的实验动物资源及成熟的实验技术体系，并依托于卫健委医学免疫学重点实验室、北京市肿瘤生物学重点实验室等实验平台的有力支持，同时，与北京大学第一医院、人民医院、第三医院、肿瘤医院等具有深入的临床合作。目前，主要聚焦下述问题研究：

     1. 探寻T细胞、ILC发育、活化过程中的新型转录因子、代谢活性物质，阐明其对免疫细胞的调节作用及机制，以及由此对区域免疫及相关疾病的影响；

     2. 结合高通量测序手段，包括单细胞测序、RNA-Seq、ATAC-Seq、CUT&TAG，发现组织器官中的新型免疫细胞亚群，及关键的转录调节机制；

     3. 探讨微生物组、表皮细胞、组织免疫细胞之间的相互调节关系，发现关键菌株或重要表皮细胞类型，阐明组织环境与免疫系统之间的互作关系。

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实验室团队及培养 

1. 科研队伍

       本实验室共有教职工3名，博士后2名，学生10名。

2. 培养模式

       实验室注重每位学生独立科研能力的培养，承担独立研究课题、熟练掌握各种实验技术、深入理解科学领域进展。同时，也注重合作能力、学科交叉、临床思维的培养，通过组织课题方向相近学生之间讨论，加强科研全局观。

       实验室每周周一开展实验小组简短讨论，汇报课题进展，探讨实验中遇到的问题，及时整理修补。

       每周一次一对一课题讨论，深入分析实验结果，探讨实验规划，解决实验瓶颈，纠正设计问题，制定实验安排。

       每周五组会，包括文献学习和工作汇报。文献学习关注前沿动态，通过实验室讨论吸收好的实验设计思路和课题研究方法。工作汇报讲述课题进展，通过组内集思广益，解决课题问题，做好阶段性的工作总结和未来的计划前瞻。

3. 实验室氛围

       钟老师注重学生的思考能力，因材施教，鼓励学生在科学问题上发散思维，着力培养学生对于科研问题的全局性把握，形成导师与学生的双向促进。

       实验氛围良好，组内通过高年级带低年级实现快速入门，研究课题有共通点的同学结成实验小组，通过内部合作，形成互相带动帮扶的工作方式，形成高效、良好的工作氛围。

       生活气氛活跃，每年组织集体春游、节日聚餐等活动。

4. 实验室依托平台工具

• 转基因及基因敲除小鼠模型平台

• BD LSRFortessaSORP流式分析平台

• 代谢组学平台

• 高通量测序平台

代表性成果及论文

1. Zhong C, Zheng M, Cui K, Martins AJ, Hu G, Li D, Tessarollo L, Kozlov S, Keller JR, Tsang JS, Zhao K, Zhu J. (2020). Differential Expression of the Transcription Factor GATA3 Specifies Lineage and Functions of Innate Lymphoid Cells. Immunity. 52(1): 83-95.

2. Zhong, C., Cui, K., Wilhelm, C., Hu, G., Mao, K., Belkaid, Y., Zhao, K., and Zhu, J. (2016). Group 3 innate lymphoid cells continuously require the transcription factor GATA-3 after commitment. Nature immunology 17, 169-178.

3. Sojka, D.K., Plougastel-Douglas, B., Yang, L., Pak-Wittel, M.A., Artyomov, M.N., Ivanova, Y., Zhong, C., Chase, J.M., Rothman, P.B., Yu, J., et al. (2014). Tissue-resident natural killer (NK) cells are cell lineages distinct from thymic and conventional splenic NK cells. eLife 3, e01659.

4. Yagi, R.＃, Zhong, C.＃, Northrup, D.L.＃, Yu, F., Bouladoux, N., Spencer, S., Hu, G., Barron, L., Sharma, S., Nakayama, T., et al. (2014). The transcription factor GATA3 is critical for the development of all IL-7Ralpha-expressing innate lymphoid cells. Immunity 40, 378-388. (＃，equal contribution)

5. Zhong, C., and Zhu, J. (2017). Small-Molecule RORγt Antagonists: One Stone Kills Two Birds. Trends Immunol. 38(4), 229-231. (invited review)

6. Zhong, C., and Zhu, J. (2015). Transcriptional Regulatory Network for the Development of Innate Lymphoid Cells. Mediators of inflammation 2015, 264502. (invited review)

7. Zhong, C., and Zhu, J. (2015). Bcl11b drives the birth of ILC2 innate lymphocytes. The Journal of experimental medicine 212, 828. (preview)

8. Zhong, C., and Zhu, J. (2015). Tet2: breaking down barriers to T cell cytokine expression. Immunity 42, 593-595. (preview)

9. Zhong, C., Li, C., Wang, X., Toyoda, T., Gao, G., and Fan, Z. (2012). Granzyme K inhibits replication of influenza virus through cleaving the nuclear transport complex importin alpha1/beta dimer of infected host cells. Cell death and differentiation 19, 882-890.

10. Zhang, H., Zhong, C., Shi, L., Guo, Y., and Fan, Z. (2009). Granulysin induces cathepsin B release from lysosomes of target tumor cells to attack mitochondria through processing of bid leading to Necroptosis. Journal of immunology 182, 6993-7000.

11. Hua, G., Wang, S., Zhong, C., Xue, P., and Fan, Z. (2009). Ignition of p53 bomb sensitizes tumor cells to granzyme K-mediated cytolysis. Journal of immunology 182, 2152-2159.

联系方式

钟超 研究员

北京大学基础医学院系统生物医学研究所

Email:[e-mail]

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  图文|钟超课题组

编辑|陶怡君

审核|汪雨嘉、杨亮、张航